История основания клуба восходит к 1892 году. Тогда был создан Club Malherbe, позже переименованный в Union Athletique de Lycee Malherbe. Юные спортсмены занимались в основном футболом, цветами клуба были белый и черный.
В 1913 году произошло слияние этой спортивной организации с Club Sportif Caennais. Однако развитию спорта в этом районе Франции помешала первая мировая война-39 спортсменов клуба погибли за период с 1914 по 1918.
Клуб Каен принял участие в матчах первого Кубка Франции, учрежденного в 1917 году.
В 1987 году клуб занял второе место во втором дивизионе. Летом 1988 года Каен перешел в первый дивизион.
Своих главных достижений клуб добился в 1992 году. Зимой 1992 года команда занимала второе место в чемпионате, уступая лишь Марсельскому Олимпику. Однако этот успешный период сопровождался финансовыми проблемами, которые испытывал Каен. В следующем сезоне клубу довелось попробовать свои силы на европейской арене-клуб провел один из лучших матчей в своей истории, победив испанскую Сарагосу со счетом 3-2. Однако вскоре Каену пришлось перейти во второй дивизион. Вернуться в первую лигу клуб смог в 1996 году, проведя весьма удачный сезон во втором дивизионе и завоевав титул чемпиона Франции второго дивизиона.
Период 1997-2004 был ознаменован открытием новых талантов, таких как Вильям Галлас, Жером Ротен и Матье Бодмер.

тренер Patrick PARIZON
президент Jean-François FORTIN

Титулы:
Чемпион второго дивизиона 1996